2011-10-10 01:42
南京農業大學生命科學學院楊志敏教授領銜的團隊在Plant Cell Environ最新9月刊上發表了有關蒺藜苜蓿microRNA的論文Genome-
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南京農業大學生命科學學院楊志敏教授領銜的團隊在Plant Cell Environ最新9月刊上發表了有關蒺藜苜蓿microRNA的論文Genome-wide identification of Medicago truncatula microRNAs and their targets reveals their differential regulation by heavy metal。該研究鑒定了蒺藜苜蓿(Medicago truncatula)中的新microRNA(miRNA),并研究了miRNA的完整表達譜和復雜度,以及它們所對應的靶標。
研究人員設置了蒺藜苜蓿種子汞處理組和無汞對照組,以此建立了2個small RNA文庫和2個降解組文庫,并進行Illumina高通量測序。每個文庫獲取了約1千萬的測序讀數。
研究人員發現了至少52條長度約為21個核苷酸的候選新miRNA與蒺藜苜蓿的基因組完全匹配。同時,發現201條miRNA代表63個已知的蒺藜苜蓿miRNA家族,包括尚未有過描述的12個保守miRNA和1個非保守miRNA。之后,研究人員利用高通量降解組測序策略鑒定出58個已知(37個保守和21個非保守)miRNA家族對應的130個靶標和18個新發現蒺藜苜蓿特有的候選miRNA家族對應的37個靶標。
(河南食品網翻譯中心 周航)
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